买卖房子协议书丢失后，起诉仍然有效。
有证据证明合同存在，例如：聊天记录、邮件等，那么起诉是有效的。商品房预售，开发经营企业应当与承购人签订商品房预售合同，预售人应当在签约之日起30日内到当地房地产管理部门和土地管理部门办理登记备案手续。如果能及时办理产权登记，自然也就不必担心因丢失合同和收据所造成的不便。
以下是一些建议：
1、收集证据：除了协议书外，还可以提供房屋交易相关的证据，如购房合同、房产证、土地使用证、购房发票、银行转账记录等。这些证据可以帮助法院了解房屋交易的基本情况。
2、证人证言：如果有第三方证人（如中介、律师、亲友等）见证了房屋交易过程，证言也可以作为证据提交给法院。
3、书面证明：如果双方曾经就房屋交易达成过口头协议，可以尝试找到当时在场的证人，出具书面证明，以证实双方确实达成了房屋交易协议。
4、调取档案：可以向房产交易中心、不动产登记部门等相关机构申请调取房屋交易的相关档案，以获取更多的证据支持。
5、请律师协助：如果对法律程序不熟悉，可以请一位专业律师提供法律咨询和代理服务。律师会根据情况，制定合适的诉讼策略，争取到合法权益。
综上所述：虽然协议书丢失会给诉讼带来一定的困难，但只要能提供足够的证据证明房屋交易的事实，起诉仍然是有效的。
【法律依据】：
《中华人民共和国民事诉讼法》
第一百一十九条
起诉必须符合下列条件：
原告是与本案有直接利害关系的公民、法人；
有明确的被告；
有具体的诉讼请求和事实、理由；
属于人民法院受理民事诉讼的范围和受诉人民法院管辖。