在公司组织架构中，处理跨部门项目管理和协作问题是非常重要的。以下是一些建议：
1.明确目标和责任：在跨部门项目启动之初，确保所有参与部门清楚项目的目标和各自的责任。明确每个部门的角色和职责，避免出现责任模糊或重叠的情况。
2.建立沟通机制：建立高效的沟通机制是跨部门项目成功的关键。可以通过定期会议、进度报告、沟通平台等方式确保各部门之间的信息共享和沟通畅通。
3.设立协调人员：在项目中设立专门的协调人员或团队，负责统筹协调各部门之间的工作。这些协调人员可以协助解决跨部门协作中出现的问题，确保项目进度顺利。
4.制定明确的流程和规范：建立统一的项目管理流程和规范，包括项目启动、执行、监控和收尾等阶段的工作流程。确保各部门遵守规范执行，提高项目管理的效率和质量。
5.激励与奖励：为促进跨部门合作，可以设立激励机制或奖励制度，奖励表现优异的团队或个人，激发他们的积极性和合作意识。
案例：某公司进行了一个跨部门的新产品开发项目，项目涉及市场部门、研发部门和生产部门等多个部门。为了解决跨部门协作问题，公司设立了一个专门的项目组，由各部门负责人组成，负责项目的统筹管理和协调工作。通过定期会议、沟通平台等方式，各部门之间保持密切的沟通和协作，最终成功推出了新产品，取得了市场的认可。