法律分析：员工涉嫌参与公司犯罪，应该及时采取措施保护自己的合法权益。员工可以通过以下方式来保护自己的权益：
1.保持沉默权：员工有权保持沉默，不自证其罪，不作无谓的口舌解释，以避免自己的话语被用来指证自己。
2.寻求法律援助：如果员工涉嫌犯罪，可以寻求律师或法律援助机构的帮助，以确保自己的权益得到保护。
3.维权申诉：如果员工被不当处理或未被公平对待，可以向劳动保障部门或相关监管机构提出申诉，要求维护自己的权益。
法律依据：
1.《中华人民共和国刑法》第一百三十三条规定：“企事业单位、机关或者其他单位的工作人员，利用职务上的便利，为犯罪分子谋取利益，给予便利，掩饰、转移犯罪所得，或者包庇、纵容犯罪分子，情节较重的，以贪污罪、受贿罪、渎职罪定罪处罚。”
2.《中华人民共和国刑法》第一百三十六条规定：“企事业单位、机关或者其他单位的工作人员，利用职务上的便利，犯罪集团的，以组织、领导、参加黑社会性质组织罪定罪处罚。”
3.《中华人民共和国劳动法》第四十四条规定：“用人单位应当依法保障劳动者的合法权益，不得违反法律、法规和职工的合法权益，侵害劳动者的人身权、财产权和其他合法权益。”