法律分析：在公司犯罪调查程序中，保护受害人的权益至关重要。受害人可以通过多种途径寻求赔偿，如刑事赔偿、民事赔偿等。公司应该积极采取措施保护受害人的合法权益，确保其获得合理、公正的赔偿。
法律依据：
1.《刑事诉讼法》第八十二条规定，受害人有权依法获得赔偿。
2.《民事诉讼法》第二百零一条规定，受害人有权向被告请求赔偿。
3.《公司法》第一百一十条规定，公司应当依法承担侵权责任，赔偿因经营活动产生的损害。
4.《中华人民共和国侵权责任法》规定，侵权人应当承担民事责任，赔偿因侵权行为造成的损害。
综上所述，公司应当积极履行赔偿义务，通过合法途径为受害人提供赔偿，保护其合法权益。同时，公司还应当加强内部管理，预防犯罪行为的发生，减少受害人的数量和程度。