专项附加扣除是每年都要申报，其应纳税所得额=（月收入-五险一金-起征点-依法确定的其他扣除-专项附加扣除）*适用税率-速算扣除数，即工资-五险一金-5000-其他，具体需要根据公积金比例与社保比例进行相应的扣除。
《国务院关于印发个人所得税专项附加扣除暂行办法的通知》第二条 本办法所称个人所得税专项附加扣除，是指个人所得税法规定的子女教育、继续教育、大病医疗、住房贷款利息或者住房租金、赡养老人等6项专项附加扣除。 第十一条 在一个纳税年度内，纳税人发生的与基本医保相关的医药费用支出，扣除医保报销后个人负担（指医保目录范围内的自付部分）累计超过15000元的部分，由纳税人在办理年度汇算清缴时，在80000元限额内据实扣除。