一、奖金纳税要扣除5000吗
扣。年终奖是企业给予员工的一项工作福利，2018年10月1日起施行了个税法最新起征点和税率，新个税法于2019年1月1日起施行。根据财政部《关于个人所得税法修改后有关优惠政策衔接问题的通知》规定，居民个人取得全年一次性奖金，符合《国家税务总局关于调整个人取得全年一次性奖金等计算征收个人所得税方法问题的通知》（国税发〔2005〕9号）规定的，在2021年12月31日前，不并入当年综合所得，以全年一次性奖金收入除以12个月得到的数额，按照月度税率表确定适用税率和速算扣除数，单独计算纳税。计算公式为：应纳税额＝全年一次性奖金收入×适用税率－速算扣除数。全年一次性奖金是指行政机关、企事业单位等扣缴义务人根据其全年经济效益和对雇员全年工作业绩的综合考核情况，向雇员发放的一次性奖金，也包括年终加薪、实行年薪制和绩效工资办法的单位根据考核情况兑现的年薪和绩效工资。
法律依据：《国家税务总局关于调整个人取得全年一次性奖金等计算征收个人所得税方法问题的通知》第一条全年一次性奖金是指行政机关、企事业单位等扣缴义务人根据其全年经济效益和对雇员全年工作业绩的综合考核情况，向雇员发放的一次性奖金。上述一次性奖金也包括年终加薪、实行年薪制和绩效工资办法的单位根据考核情况兑现的年薪和绩效工资。
二、年终奖扣税标准
1、发放年终奖的当月工资高于5000元时，年终奖扣税方式为：年终奖＊税率－速算扣除数，税率是按年终奖／12作为“应纳税所得额”对应的税率。
2、当月工资低于5000元时，年终奖个人所得税＝（年终奖－（5000－月工资））＊税率－速算扣除数，税率是按年终奖－（5000－月工资）除以12作为“应纳税所得额”对应的税率。