擅离军事职守罪判刑标准是：
1、指挥人员和值班人员擅自离职或者玩忽职守，造成严重后果的，处三年以下有期徒刑或者拘役；
2、造成特别严重后果的，处三年以上七年以下有期徒刑；
3、战时犯罪的，处五年以上有期徒刑。
战时是指国家宣布进入战争状态，部队受到作战任务或敌人突然袭击时。当部队执行戒严任务或处理突发暴力事件时，以战时论。
【本文关联的相关法律依据】
《中华人民共和国刑法》
第四百二十五条 指挥人员和值班、值勤人员擅离职守或者玩忽职守，造成严重后果的，处三年以下有期徒刑或者拘役；造成特别严重后果的，处三年以上七年以下有期徒刑。
战时犯前款罪的，处五年以上有期徒刑。