公司制定各种考核扣钱，如果是根据公司的规章制度制度的，并且罚款的金额不超过当月工资的20％的就是合法的；如果超过了当月工资的20％的，则是违法的，员工可以因此申请劳动仲裁。
原则上用人单位不得对员工工资进行扣罚，除非员工给用人单位造成了实际经济损失，或者按照规章制度的规定，用人单位可以对员工进行经济处罚，但不超过当月工资的百分之二十。
发生劳动争议可以申请劳动仲裁具体如下：
1、仲裁立案时需携带，仲裁申请书2份，申请人身份证复印件1份，相关证据复印件和证据清单2份，大部分地区还要求提交用人单位的工商登记信息；
2、提交材料齐全后，5个工作日仲裁委给予立案，给申请人出具案件受理通知书，然后通知双方开庭时间，进行开庭审理；庭审之后对双方进行调解，开庭前也许会进行调解，调解不成仲裁委下达裁决书；
3、可以请专业人士提供远程指导服务并代写劳动仲裁申请书、证据清单等法律文书。并且申请劳动仲裁期间，不耽误劳动者去新单位工作。
劳动仲裁一般立案后60天内结案；对于裁决书不服，劳动者或用人单位在收到裁决书15天内可以起诉到有管辖权的基层人民法院。
1、公司乱扣钱，劳动者可以到劳动行政部门举报或者是劳动管理监察大队投诉。
2、也可以直接申请仲裁，如果对仲裁结果不满意可以在拿到仲裁书后15天之内到法院起诉；根据国家规定在仲裁或诉讼的时候，可以要求除在规定的时间内全额支付劳动者工资报酬外，还需加发相当于工资报酬百分之二十五的经济补偿金。
3、当事人确认未违法用人单位的规章制度，或者劳动者给用人单位造成损失，用人单位要求劳动者承担责任，扣除的工资超过当事人月工资的20％的，属于用人单位乱扣工资，当事人可以申请解除劳动合同和劳动关系，并要求经济补偿。当事人可以向当地劳动监察行政部门进行举报或申请劳动仲裁。向公司所在地的劳动保障监察大队投诉反映，要求他们来就业公司进行检查，并以此来要求公司赔偿员工。