法律分析：
合并了。现在没有单独的合作医疗卡，农村的合作医疗现在和城镇居民医疗保险合并，一样用社保卡。
法律依据：
《中华人民共和国社会保险法》 第二十六条 职工基本医疗保险、新型农村合作医疗和城镇居民基本医疗保险的待遇标准按照国家规定执行。
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