法律分析：违法。毕业证书是证明学生已按国家要求完成学业，并经过考试考核符合国家相关规定，准予毕业的证明文件，校方无权扣押学生的毕业证书。从法律上讲，只要学生顺利完成了学业，无论什么理由，学校扣发学生毕业证的行为都是违法违规的。
法律依据：《中华人民共和国教育法》第十五条 对受完规定年限义务教育的儿童、少年，由学校发给完成义务教育的证书。完成义务教育证书的格式由省级教育主管部门统一制定。 受完当地规定年限义务教育获得的毕业证书或者结业证书，可视为完成义务教育的证书。
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