果树征收补偿一般按照文件以及当年的果树市场进行估价，当年的按照苗木价，多年的则按照直径、高度、宽度进行估价。但是各地区的青苗补偿标准都不一样，每亩多于规定棵数的按标准计补，少于规定棵数的则按每棵树对应的单价和实际清点棵数计补。
法律依据：《关于健全生态保护补偿机制的意见》 （十二）完善重点生态区域补偿机制。继续推进生态保护补偿试点示范，统筹各类补偿资金，探索综合性补偿办法。划定并严守生态保护红线，研究制定相关生态保护补偿。健全国家级自然保护区、世界文化自然遗产、国家级风景名胜区、国家森林公园和国家地质公园等各类禁止开发区域的生态保护补偿。将青藏高原等重要生态屏障作为开展生态保护补偿的重点区域。将生态保护补偿作为建立国家公园试点的重要内容。（国家发展改革委、财政部会同环境保护部、国土资源部、住房城乡建设部、水利部、农业部、国家林业局、扶贫办负责）
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