工资不可以从法定代表人个人账户发放。公司法定代表人用个人账户给员工发工资有可能导致公司人格与法定代表人个人人格的混同；有可能引发税务风险。公司设立的时候都是要开设账户的。如果出现了私人账户支付工资的情况，说明公司层面存在很大的制度缺陷。
公司可以从工资中代扣个税，法律规定用人单位不得克扣劳动者工资。有下列情况之一的，用人单位可以代扣劳动者工资：
1、用人单位代扣代缴的个人所得税；
2、用人单位代扣代缴的应由劳动者个人负担的各项社会保险费用；
3、法院判决、裁定中要求代扣的抚养费、赡养费；
4、法律、法规规定可以从劳动者工资中扣除的其他费用。
一、劳务工自离怎么办？
工资正常发放，用人单位不得克扣。有下列情况之一的，用人单位可以代扣劳动者工资：（一）用人单位代扣代缴的个人所得税；（二）用人单位代扣代缴的应由劳动者个人负担的各项社会保险费用；（三）法院判决、裁定中要求代扣的抚养费、赡养费；（四）法律、法规规定可以从劳动者工资中扣除的其他费用。
二、扣工资法律规定
用人单位不能克扣劳动者的工资。
但有下列情况之一的，用人单位可以代扣劳动者工资：
（一）用人单位代扣代缴的个人所得税；
（二）用人单位代扣代缴的应由劳动者个人负担的各项社会保险费用；
（三）法院判决、裁定中要求代扣的抚养费、赡养费；
（四）法律、法规规定可以从劳动者工资中扣除的其他费用。
因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。
经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
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