法律分析：根据保险法的相关规定，保险公司在赔偿时可以依据合同约定的免赔额进行抵扣或者减免。但是，在一些特殊情况下，保险公司不得否定合同约定的免赔额，例如故意或者重大过失导致的损失，被保险人没有按照合同规定支付保险费等情形。
法律依据：
1.《中华人民共和国保险法》第三十三条规定：“被保险人在保险事故发生时，应当采取适当措施防止继续扩大损失，否则，保险人可以相应地减少赔偿金额。”
2.《中华人民共和国保险法》第四十七条规定：“被保险人违反保险合同约定，故意或者因重大过失致使保险事故发生或者扩大的，保险人不负赔偿责任。”
3.《中华人民共和国合同法》第一百零五条规定：“当事人对合同格式条款的理解有争议的，解释应当有利于无专业知识的当事人。”
综上所述，保险公司在赔偿时可以依据合同约定的免赔额进行抵扣或者减免，但在一些特殊情况下，保险公司不得否定合同约定的免赔额，被保险人需要在保险事故发生时采取适当的措施防止继续扩大损失，否则保险人可以适当减少赔偿金额。
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